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Schulungsübersicht
Einführung in Fiji und ImageJ
- Überblick über Fiji und seine Anwendungen in der wissenschaftlichen Forschung
- Verständnis der Architektur und der Plugins von ImageJ
- Installation und Einrichtung von Fiji für optimale Leistung
Grundlegende Techniken der Bildverarbeitung
- Bildakquise und Importformate
- Anpassung von Kontrast und Helligkeit sowie Anwendung von Filtern
- Bildstapelung und Projektionsmethoden
Fortschrittliche Bildanalyse
- Segmentierungstechniken: Schwellwertbildung und Kantendetektion
- Zählung von Objekten und Partikelanalyse in histologischen Proben
- Messung von Flächen, Umfängen und anderen morphologischen Merkmalen
Arbeit mit biologischen Proben
- Verarbeitung von Bildern histologischer Gewebe, Blutkörperchen und Algen
- Farbdekonvolution und Analyse eingefärbter Gewebe
- Zeitraffer-Analyse und Verfolgung der Zellbewegung
Automatisierung und Anpassung
- Erstellung und Ausführung von Makros für wiederkehrende Aufgaben
- Verwendung von Fiji-Plugins für spezialisierte Analysen
- Grundlegende Programmierung mit der ImageJ Macro Language (IJM)
Datenmanagement und Berichterstattung
- Export der Ergebnisse und Erstellung von Berichten
- Annotierung von Bildern und Vorbereitung der Daten für die Publikation
- Best Practices für eine reproduzierbare Bildanalyse
Voraussetzungen
- Grundlegendes Verständnis der Konzepte der biologischen Bildgebung
- Vertrautheit mit Mikroskopie- und histologischen Techniken
- Grundlegende Computerkenntnisse
Zielgruppe
- Forschende in den Bereichen Biotechnologie und Umwelttoxikologie
- Laborfachkräfte, die mit histologischer und zellulärer Bildgebung arbeiten
- Wissenschaftler, die sich für die quantitative Bildanalyse interessieren
14 Stunden
