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Schulungsübersicht
Einführung in Fiji und ImageJ
- Überblick über Fiji und seine Anwendungen in der wissenschaftlichen Forschung
- Verständnis von ImageJs Architektur und Plugins
- Installation und Einrichtung von Fiji für optimale Leistung
Grundlegende Bildverarbeitungstechniken
- Bilderfassung und Importformate
- Kontrast- und Helligkeitsanpassungen sowie Anwendung von Filtern
- Bildstapelverarbeitung und Projektionsmethoden
Fortgeschrittene Bildanalyse
- Segmentierungstechniken: Schwellwertfestlegung und Kantenerkennung
- Objektzählung und Partikelanalyse in histologischen Proben
- Flächen-, Umfangs- und andere morphologische Merkmale messen
Arbeit mit biologischen Proben
- Verarbeitung von Bildern histologischer Gewebe, Blutkörperchen und Algen
- Farbanalyse und Analyse gefärbter Gewebe
- Zeitrafferanalyse und Zellbewegungstracking
Automatisierung und Anpassung
- Erstellen und Ausführen von Makros für wiederkehrende Aufgaben
- Verwenden von Fiji-Plugins für spezialisierte Analysen
- Grundlagen des Scripting mit der ImageJ-Makrosprache (IJM)
Datenmanagement und Berichterstellung
- Exportieren von Ergebnissen und Erstellen von Berichten
- Bilder annotieren und Daten für die Veröffentlichung vorbereiten
- Best Practices für reproduzierbare Bildanalyse
Zusammenfassung und weitere Schritte
Voraussetzungen
- Grundverständnis von biologischen Bildungskonzepten
- Kenntnisse in Mikroskopie und histologischen Techniken
- Grundkenntnisse der Computerliteracy
Zielgruppe
- Forscher in Biotechnologie und Umwelttoxikologie
- Labortechniker, die mit histologischen und zellulären Bildern arbeiten
- Wissenschaftler, die sich für quantitative Bildanalyse interessieren
14 Stunden
