Genetische Sequenzierung und Testung Schulung

Dies ist ein praktisches Workshop, der die Grundlagen der Bioinformatik einführt. Er richtet sich an Personen mit grundlegenden biologischen Kenntnissen und Wissen in Molekularbiologie, die lernen möchten, wie man biologische Daten mit computergestützten Werkzeugen verarbeitet und bearbeitet. Besonders für folgende Gruppen konzipiert:

• Forscher, die in experimentellen Laboren an biologischen Makromolekülen wie Proteinen, RNA und DNA arbeiten.
• Wissenschaftler, deren Kernkompetenz nicht Biologie ist, aber mit biologischen Daten umgehen müssen.
• Manager, die neue Produkte (z. B. Arzneimittel) einführen und ihre Kenntnisse in der modernen Bioinformatik erweitern möchten.
• Computerprogrammierer, die Programme schreiben werden, die mit biologischen Molekülen umgehen.

Der Kurs gliedert sich in zwei Teile: einen theoretischen und einen praktischen. Die Vorlesung ist durch einfache praktische Übungen, Quizfragen und Tests ergänzt, um sicherzustellen, dass die Teilnehmer die Konzepte verstehen.

Während der Schulung führen wir Sie auf einer geführten Tour durch alle grundlegenden Aspekte der biologischen Datenanalyse. Dieser Workshop bietet eine ideale Gelegenheit, sich mit der Bioinformatik und ihren verschiedenen Facetten vertraut zu machen! Am Ende sollten Sie in der Lage sein, jedes grundlegende bioinformatische Problem anzugehen: Sie werden wissen, wo die erforderlichen Daten herkommen, wie man relevante Informationen erhält und wie grundlegende Software und Algorithmen funktionieren. Unser Ziel ist es, Ihr Verständnis von biologischen Daten zu fördern.

Am Ende des Kurses werden Sie in der Lage sein, mit biologischen Daten unter Verwendung bioinformatischer Werkzeuge zu arbeiten.

Gute klinische Praxis (GCP) ist ein Satz von Richtlinien für klinische Forschung an Menschen. GCP dient als internationale Norm für die Planung, Durchführung, Überwachung, Dokumentation, Analyse und Berichterstattung von klinischen Studien.

In diesem von einem Dozenten geführten Live-Training lernen die Teilnehmer die wichtigsten Richtlinien und grundlegenden Prinzipien der Guten klinischen Praxis (GCP) für klinische Studien und Forschungen an Menschen kennen. Dieser Kurs bietet einen Überblick über die verschiedenen Bereiche von GCP, legt jedoch etwas mehr den Fokus auf ICH-gesteuerte GCP für Untersuchungsmittel und Biologika.

Am Ende dieses Trainings werden die Teilnehmer in der Lage sein:

• Die grundlegenden Prinzipien der GCP für Untersuchungsmittel und Biologika nach den Richtlinien der International Conference on Harmonization (ICH) zu verstehen
• Die in der GCP festgelegten Richtlinien auf ihre klinischen Forschungen und Studien anzuwenden

Zielgruppe

• Klinische Untersucher
• Klinische Forschungsprofis
• Gesundheits- und Medizinfachleute
• Personal zur Unterstützung von klinischen Studien
• Forschung und Entwicklungspersonal

Aufbau des Kurses

• Theoretischer Teil, Diskussionen, Übungen und intensive praktische Anwendungen

Mikrobielle Genomik und Metagenomik kombinieren Sequenzierungstechnologien und computergestützte Analysen, um mikrobielle Gemeinschaften zu profilieren, Genome zu charakterisieren und funktionale Merkmale wie Antibiotika-Resistenzen zu erkennen.

Diese von einem Dozenten geleitete, live angebotene Schulung (online oder vor Ort) richtet sich an forschungsorientierte Anfänger bis Fortgeschrittene und Bioinformatiker, die praktische Analysen mikrobieller Genomik- und Metagenomik-Sequenzdaten durchführen möchten.

Am Ende dieser Schulung werden die Teilnehmer in der Lage sein:

• Übliche Sequenzierungsabläufe und wichtige Dateiformate in der mikrobiellen Genomik zu beschreiben.
• Qualitätssicherung und Vorverarbeitung von rohen NGS-Lesen durchzuführen.
• Taxonomische Profiling-Methoden mit markerbasierten und k-Mer-Ansätzen anzuwenden.
• Mikrobielle Genome und Plasmide zu assemblieren und annotieren.
• SNPs zu erkennen, Phylogenetische Bäume aufzubauen und Populationsstrukturen zu interpretieren.
• Antibiotika-Resistenzgene vorherzusagen und funktionale Profile zusammenzufassen.
• Reproduzierbare Workflows mit Conda, Docker und notebook-basierten Berichten zu verwenden.

Kursformat

• Vorlesungen zur Einführung in Konzepte und Werkzeuge (20 %).
• Praktische Übungsstunden mit Beispiel-Datensätzen (60 %).
• Offene Diskussionen und geführte Analysen, damit die Teilnehmer ihre Methoden auf ihre Daten anwenden können (20 %).

Kursanpassungsoptionen

• Um eine angepasste Workshop-Veranstaltung, die sich auf klinische, umweltbezogene oder industrielle Metagenomik konzentriert, zu beantragen, kontaktieren Sie uns für eine Anordnung.

Dieses von einem Dozenten geleitete, live-Training in Schweiz (online oder vor Ort) richtet sich an Wissenschaftler und alle Interessierten, die die Grundlagen der Nanowissenschaft und ihre Anwendungen kennenlernen möchten.

Am Ende dieses Trainings werden die Teilnehmer in der Lage sein:

• Das Feld der Nanowissenschaften und -technologien zu verstehen.
• Zwischen Nano- und Mikroebenen zu differenzieren.
• Die grundlegende Theorie des Elektronentransports und Energietransfers zu kennen.

Dies ist ein praktischer Kurs, der zeigt, warum das Programmieren ein leistungsfähiges Werkzeug für die Lösung biologischer Probleme ist. Während des Kurses wird den Teilnehmern die Programmiersprache Python beigebracht, eine Sprache, die weithin sowohl als leistungsfähig als auch als einfach zu benutzen gilt. Dieser Kurs kann als eine Demonstration dafür angesehen werden, wie die Bioinformatik das Leben von Biologen verbessert.

Der Kurs richtet sich an Personen ohne Informatikkenntnisse, die das Programmieren lernen möchten.

Dieser Kurs ist geeignet für:

• Forscher, die mit biologischen Daten arbeiten.
• Wissenschaftler, die lernen möchten, wie sie alltägliche Aufgaben automatisieren und Daten analysieren können.
• Manager, die lernen möchten, wie das Programmieren Arbeitsabläufe und die Durchführung von Projekten verbessert.

Am Ende des Kurses werden die Teilnehmer in der Lage sein, kurze Programme zu schreiben, die es ihnen ermöglichen, biologische Daten zu manipulieren, zu analysieren und zu verarbeiten und die Ergebnisse in einem grafischen Format zu präsentieren.

Dieser Kurs soll Forschern ein Verständnis der Prinzipien der statistischen Gestaltung und Analyse vermitteln sowie deren Relevanz für die Forschung in verschiedenen naturwissenschaftlichen Disziplinen verdeutlichen.

Er behandelt einige Wahrscheinlichkeits- und statistische Methoden, hauptsächlich durch Beispiele. Dieser Kurs besteht etwa zu 30% aus Vorlesungen und zu 70% aus geführten Quizzen und Laboren.

Im Falle eines geschlossenen Kurses können wir die Beispiele und Materialien auf eine bestimmte Fachrichtung anpassen (wie psychologische Tests, öffentlicher Sektor, Biologie, Genetik usw.).

Beim Öffentlich-Kurs werden gemischte Beispiele verwendet.

Obwohl während dieses Kurses verschiedene Softwarepakete eingesetzt werden (SPSS, Statgraphics etc.), liegt der Hauptfokus auf dem Verständnis der Prinzipien und Prozesse, die die Forschung, das Argumentieren und das Schließen leiten.

Dieser Kurs kann als gemischter Kurs angeboten werden, d.h. mit Hausaufgaben und Übungen.